ODONAT se situe au centre de la toile naturaliste associative et à l'interface avec les partenaires habituels (Etat, collectivités, bureaux d'étude, etc). Il est donc à la fois animateur de réseau et interlocuteur privilégié.

Ses rôles sont notamment liés à la coordination et à l'homogénéisation à l'occasion de projets multidisciplinaires réalisés en collaboration avec les associations membres, qu'il s'agisse de projets internes ou de sollicitations extérieures. ODONAT est aussi un organisme ressource pour tous travaux, toutes demandes de renseignement ou d'information relatifs à la nature en Alsace.